要看你是否通过了宅基地的审批手续，当时村委会分基地的做法是错误的，因为村委会没有审批土地的法定权限。不知道你讲的向镇政府交的费用是什么费用，如果是审批费用，并取得了合法的用地批复，那就是合法的。如果只是交了钱，没有用地批复，那还不合法，因为镇政府也无权批地，只有县级以上国土部门才能审批土地。但镇国土所一般代办建房用地手续。
如果是你来盖房子，那肯定不行，如果以你母亲的名义不就解决了吗！
村委会以你母亲不是农村户口为由让你停工是不成立的，因为你母亲作为农村教师，已经获得了宅基地使用权。
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